长期从事深海环境微生物基因组学研究和原位生态监测设备研发，推动深海原位生物研究成为科技部2035规划的13个深海前沿方向之一。其研究开启了深海生态系统原位研究和探测，主持和设计了我国首套原位生物实验室“凤凰”号。作为项目负责人主持中科院先导专项B海斗深渊生命科学研究项目和科技部重点研发专项项目。获得2016年度国家自然科学奖二等奖（排名3），并担任“海洋十年”行动计划海洋黄昏带联合调查大科学计划下西太平洋海洋黄昏带生态系统研究计划的负责人。在国际著名期刊NatureCommunications、NucleicAcidsResearch、ISMEJ、ScienceBulletin等共发表SCI学术论文和章节120余篇，授权中国发明专利5项。SCI论文总引用次数近8000次，大会报告和论文30余次。斯坦福大学全球高引前2%学者。担任FrontierMarineScience,Microorganisms和DeepSeaResearchI的副主编和编委，eLife客座编辑，担任面向2035年国家中长期科技发展规划专家组成员等公共服务职务。
