高子琪

高子琪，2025年于香港科技大学获数据科学与分析博士学位，现任清华大学深圳国际研究生院助理教授、博士生导师。他致力于研发面向生命科学与医疗的通用基础模型，核心是探索大模型技术在该领域的创新应用。其研究通过融合多模态大语言模型、强化学习与推理技术，构建下一代生物计算基座，以支持药物发现、疾病诊断与精准治疗等关键任务，推动人工智能在生物医学中的可靠落地。

高子琪已在NeurIPS、ICML、ICLR、AAAI、Nature Communications等国际顶级会议和期刊发表多篇第一作者论文。曾获国家奖学金、日内瓦国际发明展金奖、清华大学优秀硕士学位论文等荣誉。

课题组长期招收大语言模型、AI4Science、多模态等领域的硕士、博士和科研实习生。

个人主页：https://ziqigao-tsinghua.github.io

2022年2月-2025年10月，香港科技大学，数据科学与分析专业，博士

2018年9月-2021年6月，清华大学，精密仪器系，硕士

2014年9月-2018年6月，华中科技大学，测控技术与仪器专业，学士

2026年1月-至今，清华大学深圳国际研究生院，助理教授

《AI for Science》杂志青年编委；

高子琪的研究聚焦于AI for Science领域，重点关注多模态大模型技术在生命科学领域（尤其是蛋白质方面）的应用。主要研究方向包括：

（1）通用科学智能：致力于开发以蛋白质为核心对象的下一代基础模型。通过强化学习、生物思维链推理、和多模态大模型等技术，构建具备跨模态理解、跨任务泛化与跨领域迁移能力的统一框架。

（2）科学启发的人工智能：探索如何将基础科学（如物理学、生物学）中的基本原理、结构化知识与研究方法，转化为对人工智能模型架构、训练范式与推理机制的启发与约束，从而增强主流AI模型的能力。

（3）垂域智能体：面向药物发现、蛋白质设计等垂域科学任务，通过融合强化学习、思维链推理及蒸馏等技术，实现药物发现的全流程自动化与闭环优化。

[1] Ziqi Gao, Yifan Niu, Jiashun Cheng, Jianheng Tang, Tingyang Xu, Peilin Zhao, Lanqing Li, Fugee Tsung, Jia Li. Handling Missing Data via Max-Entropy Regularized Graph Autoencoder. AAAI 2023.

[2] Ziqi Gao, Chenran Jiang, Jiawen Zhang, Xiaosen Jiang, Lanqing Li, Peilin Zhao, Huanming Yang, Yong Huang, Jia Li. Hierarchical Graph Learning for Protein–Protein Interaction. Nature Communications, 14(1): 1093, 2023.

[3] Ziqi Gao, Zijing Liu, Yu Li, Jia Li. Towards Stable Representations for Protein Interface Prediction. NeurIPS 2024.

[4] Ziqi Gao, Qichao Wang, Aochuan Chen, Zijing Liu, Bingzhe Wu, Liang Chen, Jia Li. Parameter-Efficient Fine-Tuning with Discrete Fourier Transform. ICML 2024.

[5] Ziqi Gao, Tao Feng, Jiaxuan You, Chenyi Zi, Yan Zhou, Chen Zhang, Jia Li. Deep Reinforcement Learning for Modelling Protein Complexes. ICLR 2024.

[6] Ziqi Gao, Xiangguo Sun, Zijing Liu, Yu Li, Hong Cheng, Jia Li. Protein Multimer Structure Prediction via Prompt Learning. ICLR 2024.

高子琪; 相互作用界面的预测方法、装置、电子设备及存储介质, 2023-10-31, 中国, CN202310459064.7

高子琪; 分子对接信息的预测模型训练方法、装置、设备及介质, 2023-10-27, 中国, CN202310361613.7

高子琪; 分子生成方法、装置、设备和存储介质, 2023-10-27, 中国, CN202310336184.8

国家奖学金

日内瓦发明展金奖

清华大学优秀毕业论文

香港科技大学交叉学部最佳研究奖