杨云锋

1996年获中国科学技术大学学士学位，2003年获美国爱因斯坦医学院博士学位，现任清华大学深圳国际研究生院环境与生态研究院教授。研究领域为环境基因组学。聚焦土、水、室内环境微生物对减污降碳的调控以及病原菌健康风险进行研究和基因资源挖掘，迄今已发表了220余篇学术论文，作为第一发明人获两项美国技术专利授权。2018年以来作为第一或通讯作者在PNAS、Nature Climate Change、Nature Communications、Trends in Microbiology等学术期刊上发表了多篇论文。谷歌学术被引两万余次，H 指数为67。连续多年入选科睿唯安全球高被引学者、全球前2%顶尖科学家、全国微生物与免疫学专家学术影响力百强、中国生态与演化领域前50科学家等榜单。是国家级人才项目获得者。

1996/08–2003/01 美国爱因斯坦医学院解剖和结构生物学系，微生物专业，博士

2000/01–2002/05 美国纽约城市大学计算机系，计算机科学专业，硕士 (辅修学位）

1991/09–1996/07 中国科学技术大学生物系，生物专业，学士

2023/10–今                  清华大学深圳国际研究生院，环境与生态研究院，教授

2010/09–2023/10         历任清华大学环境学院特别研究员、研究员；兼任清华大学地球系统科学系双聘教授

2006/03–2010/09         美国橡树岭国家实验室生命科学部研究员（Staff Scientist）

2003/02–2006/03         美国橡树岭国家实验室环境科学部博士后

中国生态学学会微生物生态专业委员会，副主任

兰州大学草地微生物研究中心，学术副主任

Soil Ecology Letters杂志，创刊副主编

mLife杂志，创刊副主编

研究的关键词为“功能菌群”。主要致力于协同减污、降碳的功能微生物研究。通过优化宏基因组学、分子生态网络、基因功能鉴定和土壤碳库模型等实验和数据分析工具，遵循“地理格局-响应特性-周转机制”的研究思路，探讨功能微生物在土壤和水体有机质降解及氮循环中的关键作用。发现青藏高原和内蒙古高原的土壤微生物群落具有高度的功能多样性，选择压力是驱动寒旱环境中功能菌群结构的主要因素。揭示出功能菌群对环境变化极为敏感，并提出了海洋微生物应对营养条件变化的“饥饿游戏”假说。明确了功能菌群驱动土壤碳氮周转的分子机制及其区域效应，发现微生物碳降解、产甲烷、固氮、硝化和反硝化基因的丰度与土壤有机碳降解速率、温室气体通量和硝化潜势等土壤过程密切相关，挑战了“DNA不代表活性，无法用于土壤过程分析”的传统观点；进而通过引入功能基因参数优化碳库模型的方法创新，显著提高了模型估值与实测值的拟合度，更准确地刻画了土壤碳库的变化规律。自新冠疫情爆发以来，在继续现有研究的基础上，将研究领域拓展至室内病原菌和有害病毒的检测与消减，特别是与女性炎症及癌症的关联。通过大规模挖掘功能菌群基因资源和开发与室内环境清洁、土壤固碳和减污相关的多种酶产品，为未来环境治理提供了创新的解决方案。

[1] 海南国家公园研究院，基于微生物的海南热带雨林碳排放评估与调控，2023/04-2025/12，主持

[2] 国家自然科学基金委，重点国际(地区)合作研究项目，养分添加对全球草地土壤微生物多样性和功能的影响及机理， 2021/10-2026/09，主持

[3] 国家科学技术部，基于监测的污染物自然衰减新型指标体系与衰减效率评估方法，2020/01-2023/12，主持

[4 国家自然科学基金委，国家杰出青年科学基金项目，土壤微生物学，2019/01-2023/12，主持

[5 国家科学技术部，第二次青藏高原综合科学考察课题，高原土壤微生物多样性特征，2019/01-2023/12，主持

[1] X Tao, Z Yang, J Feng, S Jian, Y Yang*, C Bates, G Wan, X Guo, D Ning, M Kempher, X Liu, Y Ouyang, S Han, L Wu, Y Zeng, J Kuang, Y Zhang, X Zhou, Z Shi, W Qin, J Wang, M Firestone, J Tiedje, and J Zhou* (2024), Climate warming accelerates positive soil priming in a temperate grassland ecosystem, Nature Communications 15 (1): 1178

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Y Yang and Y Li (2014), Transformation of Gram-Positive Bacteria by Sonoporation, U.S. Patent 8669085

第16届中国土壤学会科学技术奖一等奖（2021）

清华大学  “学术新人”奖（2014）